1.生產規模的擴大
從前畜牧業發展規模比較小，主要以家禽飼養為主，家禽數量都比較少。況且活動范圍小且比較集中，所以排泄物就很容易收集起來進而進行二次利用，不太容易對環境造成相應的污染。然而畜牧養殖業在逐漸發展起來后，每家每戶養殖的動物數量越來越多，種類越來越繁雜，這就會導致要增加活動范圍，排泄物也隨之不太容易收集。甚至很多養殖戶會采取一些粗放的養殖模式，不僅會導致動物的排泄物污染范圍越來越廣，甚至有可能污染一些比較近距離的水源，使生態環境進一步的惡化。
2.化學肥料的使用
隨著我國經濟和科學技術的不斷發展，其中農業種植會逐漸開始嘗試使用化學肥料來代替一些傳統有機肥料的使用頻率。新時代的化學肥料具備方便清潔以及價格低廉的特點，所以引起了廣大農業種植戶的追捧，這就導致失去了利用價值動物糞便的肥料不能被大量的利用起來。在這種情況下就會發生畜牧養殖工作中會出現的大量動物糞便遺留，卻不能被及時的處理和解決，進而導致堆積越來越多，最終給生態環境帶來了嚴重的影響和威脅。
3.畜牧養殖管理方式處理不妥當
如果畜牧養殖中沒有形成系統的養殖方式以及集中的養殖，就會進一步使生態環境受到較大的影響。假設牲畜排除的糞便如果不能得到及時的處理和解決，就極大可能導致糞便中病原體的傳播和擴散，而病原體的傳播卻是十分迅速并且覆蓋范圍非常廣闊的，不僅會導致環境得到污染，還會影響到人民的身體健康和財產損失。